Евгения Дерюгина родилась в Симферополе. Она — выпускница железнодорожной средней школы № 98 (ныне школа № 35), затем училась в Севастопольском судостроительном техникуме. Окончила курсы медсестёр.
Первый бой приняла под Одессой. Ходила в разведку в тыл врага. Под Одессой же получила свою первую медаль «За отвагу»: Однажды теплоход попал под очередной налёт вражеских самолетов и загорелся. Начали спешно переправлять раненых в шлюпки. Выгрузку почти закончили, когда тяжелораненый командир сказал, что в каюте остался пакет с ценными документами. Услышав это, Женя быстро вернулась на горящий корабль, нашла и спрятала под одежду пакет, а на палубу выбраться не успела — потеряла сознание. Там и нашёл её один из членов команды и на руках отнёс в шлюпку. Так появилась у Жени первая боевая награда — медаль «За отвагу».
Затем была ранена, проходила лечение в Севастополе. Вскоре приняла участие в обороне Севастополя, на позициях у Балаклавы. Эвакуировалась с бригадой в Новороссийск, участвовала в боях на Малой Земле. В апреле-мае 1944 года с ударным батальоном 83-й бригады морской пехоты Евгения Дерюгина участвовала в самых жарких боях. Только за несколько дней (с 3 по 7 мая) она вынесла с передовой восемьдесят раненых.
Евгения была убита снайпером. Похоронили её в Балаклаве, позднее, по просьбе родных, её прах был перезахоронен на Старорусском кладбище Симферополя.
Именем девушки названы улицы в двух городах:
Улица Жени Дерюгиной, Севастополь (появилась 6 мая 1969-го года) и Симферополе (1975 год).
Женя Дерюгина также изображена на огромном полотне Севастопольской диорамы.